Ca aşezare geografică, satul Pogoneşti se află în colinele Tutovei, pe cursul inferior al râului Pogoneşti, la 9 km nord de vărsarea acestuia în râul Bârlad.
Satul Pogoneşti este dispus pe direcţia nord – sud pe partea stângă a râului Tutova. Este flancat de două rânduri de dealuri paralele, orientate pe aceeaşi direcţie, culmea dinspre vest fiind mai înaltă decât cea dinspre est.
Reţeaua hidrografică din teritoriu este formată din râul Tutova, afluent al râului Bârlad. Satul Pogoneşti este aşezat pe cursul inferior al râului Tutova.
Solurile din cadrul comunei sunt constituite din soluri cenuşii, cernoziomuri cambice, regosoluri şi solurile antropice.
Climatul este temperat continental cu vădit caracter de excesivitate est – europeană. Media anuală a temperaturii este de 9,7º C, iar media anuală a precipitaţiilor este de 484 mm/m².